《多重阴影》强调事件探索与快节奏的战斗，玩家将可收集让游戏产生变化的特殊道具和各种未来武器，以克服重重阻碍、击退敌方大军，深入探索神秘的开放式游戏世界。这款游戏以知名作家Orson Scott Card（Ender’s Game战争游戏/致命儿戏的作者）的Empire三部曲为故事基础。《Shadow Complex》的故事描述主角Jason Fleming与女友前往山区探险，却遭遇到身分不明的士兵，并被卷入巨大的阴谋之中。主角必须只身潜入秘密基地，利用敌人的装备来武装自己，一边战斗一边寻找被俘女友的下落。游戏采传统2D卷轴式的动作冒险玩法，玩家可以射击、跳跃、攀爬，并且使用场景中收集到的各种武器进行战斗。游戏中取得的手榴弹、泡沫弹与火箭等武器除了是对抗敌人的利器，同时也是解谜所必需的锁钥：游戏中有各种障碍物会阻碍主角前进，玩家必须使用相对应的武器才能破解，例如泡沫弹可以破坏通风口的扇叶、火箭可以炸毁一般武器无法破坏的闸门等等。随着剧情的推展，玩家还能取得喷射背包与强化装甲，并且利用它们的特殊功能前往先前无法抵达的地方，取得额外的道具与奖励。 虽然2D玩法限制玩家只能在XY两个轴向移动，但《Shadow Complex》的画面与场景仍然是全3D构成的。敌人会从背景的转角或门口朝玩家发动攻势，或是从楼顶向下射击；当敌人出现在玩家无法前往的深度位置时，主角武器的射线会自动校正到敌人所在的轴面，大部分的时间玩家只要按下RT右发射键开火即可。要是你不满意自动锁定的效果，可以使用右类比杆手动调整射线，利用雷射瞄准器的红色光束对准你想射击的方位。
游戏的场景切分成许多区域，往来于每个区域时画面会切换，但游戏本身则是全然无接缝，没有任何读取。在游戏中按下BACK键可以开启地图，上面会标示出所有你曾经到过的区域，如果该区域有隐藏物品，地图上还会自动标出「？」，方便玩家取得解谜手段后再回头寻宝。另外，玩家可以开启指引功能，在地图上标示出正确的前进路线，避免玩家因迷路而卡关。要是谜题过不了，游戏也提供了相当的提示：主角的身上带了一把手电筒，除了照明还兼具谜题提示的效果，当手电筒的光线照在可破坏的物件上时，物件会依相对应的武器种类而发光（例如可以用枪弹破坏的会呈现亮黄色、需要用手榴弹炸开的则呈绿色）。 除了主要内容的剧情模式外，《Shadow Complex》还提供了详细的教学模式以及挑战模式。挑战模式是一连串的动作谜题，成功完成后还会依玩家所花的时间以及取得的分数进行评价。另外，游戏全程中文化。